Według analizy rRNA małej podjednostki rybosomu (18S), C. tropicalis razem z innymi przedstawicielami rodzaju Candida (C. albicans, C. parapsilosis i C. viswanathii) tworzy silnie wyodrębnioną od innych patogennych grzybów grupę.

Hodowane na stałej pożywce YPD komórki C. tropicalis są okrągłe lub owalne o wielkości 3,5–7 na 5,5–10 μm. Hodowane przez trzy dni w temperaturze 25 °C na podłożu z mąki kukurydzianej z dodatkiem detergentu Tween 80 tworzą blastokonidia, pojedyncze lub w małych grupach, zebrane wzdłuż osi długiej pseudostrzępki. Czasami obecne są prawdziwe strzępki, a rzadko obserwuje się tworzenie chlamydospor w kształcie wydłużonych kropel.

Kolonie na płytkach YPD są okrągłe, w kolorze kremowym, przy brzegach czasami pomarszczone lub ze strzępkami grzybni.