2 kwietnia 1644 Piotr Gembicki, biskup krakowski, skasował tytuł plebania, i nadał proboszczowi prepozyta. Największy dzwon jest również fundacją Misiowskich w 1660 r.
Za czasów wojen szwedzkich odbyła się pod Irządzami bitwa między wojskami polskimi a najeźdźcą Rakoczym. Kościół i wieś były zrabowane i spalone. Po wojnie kościół został odbudowany, ale stracił dawną okazałość: mury i wieża zostały obniżone, a sklepienia zostały zastąpione belkowanym stropem z desek. Wygląd kościoła opisano w Dziejach Polski Augusta Sokołowskiego. Dalszą historię kościoła przekazuje płyta pod chórem z napisem:
Ku powiększeniu chwały Bożej kościół za bytności śp. ks. Kanonika Przybyłko, proboszcza tutejszej parafii staraniem wielkiego księcia Kajetana Szymkiewicza wikariusza tutejszej parafii w r. 1894. Pomalowany staraniem wielkiego księcia Noszczyka wikariusza tej parafii, kosztem pobożnych parafian w 1910 r.
Podczas tej restauracji dodane zostały kaplice i kruchta frontowa.