Ze względu na znaczącą liczbę Polaków i Słowaków w swym gronie, w 1967 Kościół zmienił nazwę na obecną w brzmieniu: Kościół Braterski (Církev bratrská).
W związku z podziałem Czechosłowacji w 1993, nastąpił również podział Kościoła Braterskiego na dwie odrębne denominacje w Czechach i Słowacji.
Doktryna i praktyka Kościół Braterski w Czechach i Kościół Braterski na Słowacji utożsamiają się z trynitaryzmem i chrystologią wyrażoną w ekumenicznych wyznaniach wiary, w tym w credo nicejsko-konstantynopolitańskim. Wyznają protestancką naukę o zbawieniu. Zbory posiadają szeroką autonomię, w demokratyczny sposób wybierają duchownych. Chrzest udzielany jest zarówno niemowlętom, jak i dorosłym. Eucharystia rozdzielana jest wszystkim wiernym w formie chleba i wina.
Statystyka i współpraca międzynarodowa W 2001 Kościół Braterski liczył 9931 członków w Czechach i 3217 w Słowacji. Składa się z autonomicznych zborów, ponad 70 w Czechach i kilkunastu w Słowacji. W 2013 Kościół Braterski w Czechach liczył ponad 10 000 wiernych (7185 pełnoprawnych członków i 2999 sympatyków, w tym dzieci), skupionych w 76 zborach.