W 1970, wraz z odejściem prof. Lutomskiej na emeryturę, Jadwiga Pawlak została kierownikiem Zakładu Stomatologii Zachowawczej Instytutu Stomatologii Akademii Medycznej w Gdańsku. Od października 1973 kierowała wyodrębnionym z Zakładu Stomatologii Zachowawczej Zakładem Stomatologii Dziecięcej, w ramach którego prowadzono prace kliniczne i epidemiologiczne, badania doświadczalne i zajęcia dydaktyczne w zakresie stomatologii dziecięcej oraz paradontologii i schorzeń błony śluzowej jamy ustnej. W 1974 uzyskała specjalizację ze stomatologii zachowawczej i stomatologii dziecięcej, a 15 maja 1975 otrzymała stopień doktora habilitowanego po przedstawieniu pracy Próba oceny szkodliwości dwuchlorodwufenylotrójchloroetanu (DDT) dla błony śluzowej oraz przyzębia, przygotowanej po wieloletnich stomatologicznych badaniach doświadczalnych na chomikach złocistych i szczurach. Od 1976 była docentem, od listopada 1982 nosiła tytuł naukowy profesora nadzwyczajnego, od lutego 1983 zajmowała stanowisko profesora Akademii Medycznej w Gdańsku. Pełniła też na uczelni funkcje administracyjne: kierownika Oddziału Stomatologicznego (1978–1981) i zastępcy dyrektora Instytutu Stomatologii (1975–1978).