W latach 2008-2012 był dziekanem Wydziału Filozofii i Socjologii UW. Tytuł profesorski uzyskał w roku 2012.
Przez cały okres pracy zawodowej Jacek Migasiński prowadził różne formy zajęć dydaktycznych w Uniwersytecie Warszawskim, ale również przez dziewiętnaście lat, od początku lat dziewięćdziesiątych, w Uniwersytecie Mikołaja Kopernika w Toruniu. Był promotorem 49 magisteriów i 12 doktoratów, recenzentem przewodów doktorskich, habilitacyjnych i profesorskich. Był członkiem Rad Programowych kilku polskich periodyków filozoficznych i nadal jest przewodniczącym Rady Programowej wydawanego przez IFiS PAN „Archiwum Historii Filozofii i Myśli Społecznej” oraz jednym z redaktorów pisma „Przegląd Filozoficzno-Literacki”. Jacek Migasiński był tutorem Akademii »Artes Liberales«.
Jacek Migasiński jest członkiem-założycielem Polskiego Towarzystwa Fenomenologicznego i członkiem Polskiego Towarzystwa Filozoficznego. W młodości był czynnym zawodnikiem sekcji pływackiej KKS Polonia Warszawa, do chwili obecnej rekreacyjnie uprawia żeglarstwo i narciarstwo alpejskie.