Jest uczestnikiem i koordynatorem wielu międzynarodowych badań naukowych takich jak: ART., ASSERT, CT-CP003, FREEDOM, HA-008, INO-1001, RSD 1235, RIME, STICH, SYNTAX.
Odznaczenia i nagrody Jest członkiem towarzystw naukowych: Polskiego Towarzystwa Kardiologicznego, Polskiego Towarzystwa Torako-Kardiochirurgicznego, European Association for Cardiothoracic Surgery, International Society of Cardio-Thoracic Surgeons (ISCTS), Society of Cardiothoracic Section of Great Britain & Ireland, Society of Minimal Invasive Surgery.
Za zasługi dla rozwoju kardiochirurgii został nagrodzony medalem Polskiego Towarzystwa Lekarskiego Gloria Medicine oraz Medalem Computer Honor Awards. Prof. Andrzej Bochenek jest kawalerem Krzyża Oficerskiego Orderu Odrodzenia Polski. Jest laureatem „Platynowego Lauru Kompetencji i Umiejętności”. Za osiągnięcia naukowe został laureatem wielu nagród resortowych Ministra Zdrowia, Rektora Śląskiego Uniwersytetu Medycznego, Polskiego Towarzystwa Kardiologicznego i Wojewody Śląskiego.
W roku 2009, wraz z żoną Krystyną, otrzymał Nagrodę im.