Działalność Głównymi formami działalności stowarzyszenia jest: zabezpieczanie medyczne zgromadzeń: pielgrzymek i uroczystości religijnych, zawodów sportowych, koncertów, kongresów i imprez kulturalnych, transportowanie chorych własnymi karetkami, prowadzenie działalności wychowawczej wśród młodzieży przez tworzenie grup kadetów, prowadzenie działalności socjalnej przez opiekę nad bezdomnymi w przytułkach dla bezdomnych, opieka nad osobami starszymi w „Domu Spokojnej Jesieni”, pomoc w przedszkolu w Maltańskim Centrum Pomocy Niepełnosprawnym Dzieciom i Ich Rodzinom, działalność w Klubie Honorowych Dawców Krwi, prowadzenie kursów pierwszej pomocy.
Struktura W Polsce znajduje się 8 oddziałów: Chrzanów, Kraków, Mszana Dolna, Myślenice, Słupsk, Sucha Beskidzka, Tarnów i Tarnówka. Działalność Malty Służby Medycznej jest oparta na wolontariacie i nikt z jej członków nie pobiera wynagrodzenia.
Walne Zgromadzenie Delegatów Naczelną władzą Stowarzyszenia jest Walne Zgromadzenie Delegatów, zwoływane raz do roku jako zgromadzenie zwyczajne, a co 3 lata, jako wyborcze – w związku z upływem kadencji Zarządu Głównego.
Zarząd Główny Zarząd Główny Stowarzyszenia wybierany jest na 3-letnią kadencję.
Obecnie (2017 r.) funkcję Komendanta Głównego MSM pełni Marek Radomski