1100 obrazów, oprócz portretów były to również sceny rodzajowe i pejzaże. W 1782 artysta założył pierwszą w Stanach Zjednoczonych galerię sztuki, w której prezentował własne obrazy i dzieła swoich licznych potomków. Interesował się historią naturalną i przyrodoznawstwem, wiele podróżował, gromadził osobliwości przyrodnicze i skamieniałości, posiadał m.in. szkielet pierwszego mastodonta, jaki wykopano w Ameryce. Jego galeria sztuki stopniowo przekształciła się w muzeum historii naturalnej, znane później pod nazwą Peale's Baltimore Museum and Gallery of Fine Arts. Instytucja przetrwała do 1997, gdy jej zbiory włączono do Maryland Historical Society.
Peale był również wynalazcą, opracował nowy typ okularów, zajmował się także protetyką stomatologiczną, m.in. wykonał protezę dla George’a WashingtonaTheFreeDictionary's Encyclopedia. Posiadał prawa patentowe do urządzenia, które umożliwiało wykonanie pisma w dwóch egzemplarzach. Napisał i wydał kilka książek o różnorodnej tematyce m.in. Building Wooden Bridges (1797), Discourse Introductory to a Course of Lectures on Natural History... (Filadelfia, 1800), Epistle on the Means of Preserving Health i Domestic Happiness (1816).