Szkolnictwo katolickie zrzeszone jest w Radzie Szkół Katolickich będącą jednostką organizacyjną erygowaną w 1994 roku przez Episkopat Polski. Rada wspiera szkoły w zakresie organizacyjno-prawnym i formacyjnym m.in. przez szkolenia kadr kierowniczych w zakresie zarządzania oświatą.
Największą liczbę szkół katolickich w Polsce prowadzi powstałe 11 listopada 1990 Stowarzyszenie Przyjaciół Szkół Katolickich (ponad 100 przedszkoli i szkół na różnych poziomach kształcenia w całej Polsce: w 15 diecezjach i 9 województwach). Głównie są to placówki oświatowe, którym ze względów ekonomicznych groziła likwidacja, a które nie tylko udało się uratować przed zamknięciem, ale także znacząco podnieść w nich poziom kształcenia. Za swoją działalność SPSK zostało nagrodzone prestiżową nagrodą „Pro publico bono” w konkursie na najlepszą inicjatywę obywatelskąH. Szeloch, Program wychowawczy Stowarzyszenia Przyjaciół Szkół Katolickich jako próba odpowiedzi na nauczanie Magisterium Kościoła dotyczące wychowania chrześcijańskiego w szkole katolickiej, [w:] Warszawskie Studia Pastoralne 15/2012, s. 207–208. ISSN 1895-3204. Por także: Tenże, Shaping the attitudes of catholic school pupils in light of selected recommendations of the educational program of the AFCS and guidelines of the CCS in Poland, [w:] Warsaw Pastoral Studies 18/2012, s.