22 maja 1941 r. ks. Mroczek został aresztowany, w kaplicy seminarium salezjańskiego na Łosiówce. Osadzony w więzieniu Montelupich, a później przewieziony do niemieckiego obozu koncentracyjnego Auschwitz-Birkenau i tam otrzymał numer obozowy 17340. Był bity, cierpiał okropne męki, a rany, które powstały wskutek pobicia, nie goiły się, puchły, za to gromadziły ropę w całym organizmie. Zmarł 5 stycznia 1942 r.
Proces beatyfikacyjny Jest jednym z 122 Sług Bożych, wobec których 17 września 2003 rozpoczął się drugi proces beatyfikacyjny drugiej grupy polskich męczenników z okresu II wojny światowej. 24 maja 2011 w Pelplinie zakończył się etap diecezjalny, a wszystkie dokumenty przesłano do Kongregacji Spraw Kanonizacyjnych w Rzymie.
Decyzją Postulatora generalnego Księży Salezjanów w 2018 roku wyodrębniono kapłanów z procesu pelplińskiego.
Papież Leon XIV dnia 24 października 2025 roku podpisał dekret o męczeństwie, a także wyznaczył beatyfikację na dzień 6 czerwca 2026 w Krakowie.