Dzwony Kościół św. Jana dysponuje znakomitym tak historycznie jak i brzmieniowo zestawem 5 dzwonów. Zestaw główny składa się z 3 dużych dzwonów. Największy z nich, Apostelglocke, został odlany w 1436 przez Gherta Klinghe w Bremie i stanowi wybitny przykład sztuki ludwisarskiej czasów, w których powstał. Zestaw pomocniczy stanowią dwa dzwony Schelle (duży i mały). Zestaw uzupełniają 2 dzwony zegarowe.
W porównaniu z pozostałymi kościołami Starego Miasta kościół św. Jana ma najcięższy dzwon (ok. 11,6 t), kościół św. Mikołaja dzwon o najniższej tonacji(a0) natomiast kościół św. Michała największy ilościowo zestaw (10 dzwonów).
Nr. Nazwa Rok odlania Ludwisarnia Średnica(m) Waga(t, ok.) Wysokość tonu(16tel) 1 Apostelglocke 1436 Ghert Klinghe, Bremen 1,9445,204 h0–8 2 Sonntagsglocke 1718 Johann Christoph Ziegener,Lüneburg 3,00 2,500 cis1–2 3 Probeglocke 1607 Paul Voß, Lüneburg 1,35 2,000 e1 –1 4 Große Schelle 1436 Ghert Klinghe, Bremen 0,600 d2 –8 5 Kleine Schelle 1519 Hinrik van Kampen, Lübeck 0,500 e2–4 I Stundenglocke 1516 Hinrik van Kampen, Lübeck II Viertelstundenglocke 1600 Andreas Heineken, Lüneburg