Organy mają następującą dyspozycjęDyspozycja organów została opracowana na podstawie stron: Wirtualne Centrum organowe – Słownik terminów organowych https://web.archive.org/web/20200321105720/http://www.organy.pro/slownik.php i Gdańskie Organy – Organy Katedry w Oliwie, autor Marek Michalak https://web.archive.org/web/20200321105720/http://www.organy.pro/slownik.php https://web.archive.org/web/20120315132930/http://www.gdanskie-organy.com/organs.php?lang=pl&loc=oliwa&tab=stoplist. Wynika z nich, iż w polskiej terminologii obowiązuje terminologia niemiecka, jakkolwiek niektóre nazwy instrumentów mogą być tłumaczone na jęz. polski, jeżeli mają odpowiedniki.: Hauptwerk II C-g3 Oberwerk III C-g3 Rückpositiv I C-g3 Pédale C-f1Prinzipal 16'Quintadena 16'Oktave 8'Gedackt 8'Oktave 4'Nachthorn 4'Quinte 22/3'Oktave 2'Bauernflöte 2'Mixtur 6-8f, 11/3'Scharff 4-5f, 2/3'Trompete 16'Trompete 8'Trompete 4'Prinzipal 8'Rohrflöte 8'Oktave 4'Blockflöte 4'Nasat22/3'Gemshorn 2'Terzian 2fOktave 1'Mixtur 5-6f, 1'Zimbel 3f, 1/6'Trompete 8'Dulzian 8'Prinzipal 8'Gedackt 8'Quintadena 8'Oktave 4'Rohrflöte 4'Sesquialtera 2fWaldflöte 2'Sifflöte 11/3'Scharff 5-7f, 1'Dulzian 16'Bärpfeife 8'Prinzipal 16'Untersatz 16'Oktave 8'Gedackt 8'Oktave 4'Nachthorn 2'Bauernflöte 1'Rauschpfeife 2fMixtur 6-8f, 2'Posaune 32'Posaune 16'Trompete 8'Trompete 4'Kornett