w samym kościele podniesiono posadzkę o 3 m. Przestrzeń wewnątrz uległa wyraźnemu zmniejszeniu, powstała za to obszerna piwnica.
W 1834 wyburzono znajdujący się przy kościele budynek klasztoru.
Kościół św. Jana jest dziś jedynym zachowanym kościołem klasztornym Bremy. Po wcześniejszym klasztorze dominikanów z kościołem św. Katarzyny pozostał dziś tylko ślad w nazwie pasażu handlowego Katharinenpassage w centrum miasta. Z kolei istniejący przed bramą miejską klasztor św. Pawła został zniszczony w 1546 w trakcie konfliktu zbrojnego.
Budynek kościoła św. Jana stanowi wybitne dzieło gotyku ceglanego. Wszystkie trzy nawy kościelne zostały nakryte jednym, wysokim dwuspadowym dachem. Wysoki szczyt zachodni otrzymał kunsztowną formę architektoniczną. Jest on trzykondygnacyjny, bogato dekorowany od strony ulicy ostrołukowymi blendami. W zwieńczeniu szczytu została umieszczona okrągła blenda wypełniona sześcioramienną gwiazdą. Szczyt flankowany jest dwiema wieżyczkami, zwieńczonymi spiczastymi hełmami. Zgodnie z regułą franciszkanów kościół nigdy nie miał wieży. Na dachu zbudowano jedynie wysoką sygnaturkę.
Wspólnota parafialna Parafie św. Jana i św. Elżbiety w dzielnicy Hastedt połączyły się 1 stycznia 2007 w jedną parafię. Nowa parafia nosi w dalszym ciągu wezwanie św.