Wkrótce po II wojnie światowej zarejestrowano 4 związki wyznaniowe: Kościół Metodystów – 5 września 1945 Polski Kościół Katolicko-Narodowy – 1 lutego 1946 Unia Zborów Adwentystów Dnia Siódmego – 26 kwietnia 1946 Polski Kościół Ewangelicznych Chrześcijan Baptystów – 5 maja 1946. Rejestracja tych czterech wyznań była wynikiem legalnego działania wymienionych Kościołów w warunkach okupacji hitlerowskiej.
Następnie zarejestrowano: Polski Kościół Starokatolicki – 5 września 1947 (zdelegalizowany w roku 1965) Kościół Starokatolicki Mariawitów w RP – 5 września 1947 (potwierdzenie 31 października 1967)
Kolejne rejestracje przeprowadzano dopiero po zmianach politycznych, jakie nastąpiły w październiku 1956 roku.
Na podstawie Dekretu o stosunku państwa do Kościoła katolickiego w Rzeczypospolitej Polskiej z 9 lutego 1953 zastąpionego dekretem z 31 grudnia 1956 określono warunki obsadzania stanowisk duchownych. Zgodnie z art. 9 ustawy przepisy tego dekretu zastosowano również do innych Kościołów i związków wyznaniowych.