7 września 2018 podpisał kontrakt obowiązujący do 30 czerwca 2020, z izraelskim klubem Maccabi Netanja, występującym w Ligat ha’Al. Jeszcze przed końcem obowiązującego kontraktu, bo 7 czerwca 2020 poprosił o opuszczenie klubu.
24 lipca 2020 podpisał kontrakt do czerwca 2022, z występującą w Ekstraklasie, Wisłą Kraków.
11 lutego 2021, w ostatnich godzinach okna transferowego, został wypożyczony do Bene Jehudy.
Kariera reprezentacyjna Był reprezentantem Czarnogóry w kategorii wiekowej U-21 (2008-2010).
28 marca 2009 Beqiraj zadebiutował w seniorskiej reprezentacji Czarnogóry na stadionie Pod Goricom podczas eliminacji strefy UEFA do Mistrzostw Świata 2010 w przegranym 0:2 spotkaniu przeciwko reprezentacji Włoch. W 71. minucie tego spotkania zmienił na boisku Radomira Đalovicia.
Statystyki +Występy i bramki podczas występów klubowychKlubSezonLigaPuchary krajowePuchary kontynentalneŁączniePoziomWystępyBramkiWystępyBramkiWystępyBramkiWystępyBramkiBudućnost Podgorica2007/081. CFL159––1592008/093218–2Występy w Lidze Mistrzów UEFA.234202009/103010–2Występy w Lidze Europy UEFA.032102010/1142–4284Łącznie8139–848943Dinamo Zagrzeb2010/111.