Seria Millenium Anguirus wystąpił w filmie Godzilla: Ostatnia wojna jako jeden z potworów atakujących cały świat. Celem Anguirusa był Szanghaj. Siły Obrony Ziemi (oryg. Earth Defense Force) wysłały tam jeden ze swój latający okręt bojowy Karyu, jednak Anguirus unikał ataków. Podczas potyczki nagle został teleportowany, co spotkało też inne potwory. Za teleportacją stali kosmici zwani Xilieniami, chcący ocalić Ziemian. Jednak okazało się, że to Xilieni stali za atakami potworów jako część planów podbicia Ziemi. Anguirus przy wsparciu xilieńskich statków kontynuował destrukcję Szanghaju i zniszczył Karyu. Doktor Miyuki Otonashi wykazała, że Anguirus i inne potwory mają w sobie , dzięki czemu Xilieni mogą je kontrolować. W odpowiedzi Siły Obrony Ziemi (oryg. Earth Defense Force) wypuściły z Obszaru G (oryg. Area G) Godzillę, gdyż ten jest pozbawiony zasady M i może stanowić największą obronę Ziemi. Dowódca Xilienów rozkazał teleportowanie Anguirusa wraz z Rodanem i Kingiem Caesarem u podnóża góry Fudżi, gdzie ścierają się z przybyłym Godzillą.