Jego ciało spoczywa w rzymskim Panteonie.
Rodzina W 1842 roku poślubił swoją siostrę cioteczną, arcyksiężniczkę austriacką – Marię Adelajdę Habsburg (1822–1855), córkę Rainera, wicekróla Lombardo-Wenecji i Marii Franciszki Carignano (obydwoje byli praprawnukami hr. Stanisława Krasińskiego, generała WP i Anieli Humieckiej). Mieli oni kilkoro dzieci: Klotylda Maria (1843–1911) ∞ Napoleon Józef Bonaparte, bratanek Napoleona I Humbert I (1844–1900), król Włoch ∞ Małgorzata Sabaudzka Amadeusz I (1845–1890), król Hiszpanii ∞ (1) Maria Wiktoria del Pozzo della Cisterna ∞ (2) Maria Letycja Bonaparte Otton Eugeniusz (1846-1866), książę Montferrat Maria Pia (1847–1911) ∞ Ludwik I, król Portugalii Karol Albert (1851–1854), książę Chablais Wiktor Emanuel (1852) Wiktor Emanuel (1855), hrabia Genui
W 1869 roku Wiktor Emanuel zawarł małżeństwo morganatyczne ze swoją kochanką, Różą Vercellaną (1833–1885), nazywaną Bela Rosin, która od 1858 roku nosiła tytuł hrabiny Mirafiori i Fontanafredda. Para miała dwoje dzieci: Wiktorię Guerrieri (1848-1905) Emanuela Alberta Guerrieri (1851–1894), hrabiego Mirafiori i Fontanafredda