Model S600 w obydwu wariantach roadster i coupé dostępne były w wersji podstawowej oraz specjalnej o oznaczeniu SM600 zawierającej dodatkowe elementy wyposażenie, takie jak – specjalne kolory nadwozia, ekskluzywne oznaczenia, specjalną antenę w daszku przeciwsłonecznym pasażera, lepsze poduszki w siedzeniach, szyny pod siedzeniem pasażera w celu szybkiego usunięcia fotela, a także ogrzewanie, radio i głośniki, światła cofania oraz zapalniczkę.
Produkcja Hondy S600 była większym sukcesem, niż jej protoplasta, Honda S500. Faktem jest, że z trzech produkowanych silników o tej pojemności dla sportowych samochodów, Honda S600 miała najlepsze osiągi.
Honda zbudowała 3912 roadsterów w 1964 roku oraz 7261 roadsterów i 1519 coupé w 1965 roku. Produkcja zakończyła się w 1966 roku (kiedy zaprezentowano model S800) ze sprzedanymi 111 roadsterami i 281 sztukami wersji coupé, dając całość na poziomie 11 284 sztuk w wersji kabriolet i 1800 w wersji coupé w ciągu trzech lat sprzedaży.