Informacje o lekach zebrane są w postaci karty leku (ang. DrugCard). Każda substancja posiada oddzielną kartę z przypisanym unikatowym identyfikatorem w formacie DBnumerkarty, np. DB00203 (Sildenafil). Karta leku zawiera 103 pola, podzielone na trzy części: Drug Field (kolor niebieski) – pola dotyczące danego leku, Target Field (kolor czerwony) – pola dotyczące białka docelowego, Enzyme Field (kolor zielony) – pola dotyczące enzymu metabolizującego lek.
DrugBank umożliwia ściągnięcie: sekwencji białek/genów w formacie FASTA, wzorów strukturalnych wszystkich leków w formacie SDF, wszystkich kart leków w jednym pliku tekstowym (o rozmiarze około 85 MB).
Wyszukiwanie informacji DrugBank pozwala na wyszukiwanie informacji na cztery sposoby: Wyszukiwarka – wyszukiwanie poprzez podstawowe pola wyszukiwania znajdujące się na każdej podstronie serwisu lub cztery podtypy wyszukiwania, znajdujące się w zakładce Search: ChemQuery – zawiera cztery możliwości wyszukiwania: Structure – narzędzie pozwalające wyszukać narysowany dwuwymiarowy wzór strukturalny, Molecular Weight – filtr substancji w granicach podanych mas atomowych i typu leków, SMILES – wyszukiwanie na podstawie wpisanego kodu SMILES, Chemical Formula – wyszukiwanie substancji na podstawie wpisanego wzoru chemicznego. TextQuery – wyszukiwanie tekstowe z