W 1974 rehabilitację anulowano; biskup Korec został skierowany do więzienia w celu odbycia pozostałych 4 lat z pierwotnego wyroku, ostatecznie jednak zwolniono go ze względu na stan zdrowia. Stracił jednak pracę i przez pewien czas pozostawał bezrobotny, potem ponownie został zatrudniony w fabryce.
W styczniu 1990 objął funkcję rektora seminarium w Bratysławie, miesiąc później został mianowany biskupem Nitry. Objął jednocześnie stanowisko przewodniczącego Regionalnej Konferencji Episkopatu Słowacji. W czerwcu 1991 Jan Paweł II wyniósł go do godności kardynalskiej, nadając tytuł prezbitera Ss. Fabiano e Venanzio a Villa Fiorelli. W październiku 1999 kardynał Korec brał udział w II sesji specjalnej Światowego Synodu Biskupów w Watykanie, poświęconej Kościołowi europejskiemu.
W styczniu 2004 ukończył 80 lat i utracił prawo udziału w konklawe; nie mógł wziąć udziału w wyborze następcy Jana Pawła II, a w czerwcu 2005 nowy papież Benedykt XVI przyjął jego rezygnację z godności biskupa Nitry.
Odznaczenia Order Andreja Hlinki I Klasy – 1999 Order Ľudovíta Štúra I Klasy – 1995
Wyróżnienia 5 października 2003 – doktorat honoris causa UKSW 21 stycznia 2009 – doktorat honoris causa Katolickiego Uniwersytetu w Rużomberku.