W starciu z flagowym okrętem admirała de Ruytera "De Zeven Provinciën", "Royal James" stracił maszty i musiał wycofać się z przegranej dla Anglików bitwy.
"Royal James" ponownie wziął udział w bitwie pod North Foreland. Tym razem głównodowodzący flotą angielską książę Rupert wywiesił swą flagę na "Royal Charles", ale po poważnym uszkodzeniu flagowego okrętu, musiał przesiąść się na pokład dobrze mu znanego "Royal James".
W roku 1667 flota holenderska pod dowództwem admirała de Ruytera dokonała śmiałego rajdu zadając Anglikom duże straty na rzece Medway. "Royal James", znajdujący się wtedy w porcie w Chatham, został zatopiony i porzucony przez własną załogę, aby nie dostał się w ręce wroga. Wystające z wody nadbudówki i takielunek zostały następnie podpalone przez holenderskie brandery.
Częściowo zniszczony "Royal James" został następnie wydobyty i całkowicie odbudowany jako nowy okręt "Royal James".
Bibliografia Brian Lavery, Ships of the Line Volume I: Development of the Battlefleet 1650–1850, Naval Institutre Press, Annapolis