Piotra Apostoła 1 października 1989 List apostolski na pięćsetlecie ewangelizacji Nowego Świata 29 czerwca 1990 List do Kościoła w Polsce w związku z ustanowieniem nowej organizacji kościelnej – 25 marca 1992 Ordinatio sacerdotalis 22 maja 1994 Tertio millennio adveniente 10 listopada 1994 Orientale lumen 2 maja 1995 List apostolski na 400-lecie unii brzeskiej 12 listopada 1995 List apostolski na 350-lecie unii użhorodzkiej 18 kwietnia 1996 Operosam Diem 1 grudnia 1996 Laetamur magnopere 15 sierpnia 1997 Divini Amoris Scientia 19 października 1997 Dies Domini 31 maja 1998 Inter Munera Academiarum 28 stycznia 1999 List z okazji 300-lecia unii Greckokatolickiego Kościoła Rumunii z Kościołem Rzymskim 7 maja 2000 Novo millennio ineunte 6 stycznia 2001 Z okazji 1700-letniej rocznicy Chrztu Armenii 17 lutego 2001 List apostolski do katolików z Węgier na zakończenie „Millennium Węgierskiego” 25 lipca 2001 Misericordia Dei 2 maja 2002 Rosarium Virginis Mariae o Różańcu Świętym 16 października 2002 Spiritus et Sponsa – z okazji czterdziestej rocznicy ogłoszenia Konstytucji Sacrosanctum concilium o Liturgii Świętej 4 grudnia 2003 Mane nobiscum Domine – z okazji Roku Eucharystii (X-2004 – X-2005) ogłoszony 7 października 2004 Gwałtowny rozwój 24 stycznia 2005