Odcinek pierwszy Początkiem szlaku może być jezioro Gremzdy. Stamtąd trasa prowadzi przez jeziora Głuche, Jurkowo, Miałkie, a następnie rzeką Gremzdówką na Czarną Hańczę, około 2 km przed stanicą wodną w Wysokim Moście. Ten 10-kilometrowy odcinek na większości długości uważany jest za łatwy z wyjątkiem rzeczki, gdzie spotkać można zwalone drzewa; w końcowym odcinku Gremzdówki trzeba też przebijać się przez gęste szuwary.
Częściej jednak za początek trasy uważa się jezioro Wigry, gdzie kajaki można zwodować w Starym Folwarku, miejscowości Gawrych Ruda, w Bryzgielu lub przy klasztorze w Wigrach (patrz mapka po prawej). Ta trasa jest nieco dłuższa. Od miejscowości Gawrych Ruda jest to odległość około 100 km. Po przepłynięciu Wigier dopływa się do niewielkiego jeziora Postaw, a po jego przebyciu szlak prowadzi już Czarną Hańczą.
Odcinek drugi Odcinek ten liczący 16,5 km zaczyna się od zrujnowanej stanicy wodnej w Wysokim Moście a kończy na stanicy we Frąckach. Trasa częściowo przepływa przez Wigierski Park Narodowy. Ze względu na walory widokowe, odcinek ten uznawany jest za jeden z ciekawszych. Jednocześnie jest to trasa łatwa, choć jest na niej sporo meandrów. thumb|left|200px|Na rzece spotkać można pnie przegradzające drogę