13 października 1888 cerkiew została poświęcona w obecności wielkich książąt Sergiusza Aleksandrowicza i Pawła Aleksandrowicza oraz wielkiej księżnej Elżbiety FiodorownyЧлены Иерусалимского отделения ИППО приняли участие в торжественной литургии в праздник Покрова Богородицы в храме Марии Магдалины, освященном 120 лет назад. Ceremonię przeprowadził patriarcha Jerozolimy NikodemP. Paszkiewicz, W służbie..., s.215. Wielka księżna Elżbieta została pochowana w cerkwi w 1921 razem z zamordowaną razem z nią mniszką Barbarą. W cerkwi znajduje się cząstka jej relikwiiДмитрий Урушев Скорбный путь великой княгини. Wzniesienie cerkwi spotkało się z nieprzychylną reakcją katolików, którzy uważali, że wzniesienie cerkwi prawosławnej w ogrodzie Oliwnym ma na celu zniechęcenie pielgrzymów różnych wyznań chrześcijańskich do modlitwy w ich sanktuariach. Padały jednak również głosy wysoko oceniające architekturę cerkwi rosyjskich w JerozolimieP. Paszkiewicz, W służbie..., s.221.
Od 1934 przy cerkwi działała żeńska wspólnota monastyczna Zmartwychwstania Pańskiego, którego zakonnice prowadzą szkołę dla dzieci prawosławnych Arabów.