Najlepsze wyniki w Pucharze Świata osiągnął w sezonie 2003/2004, który ukończył na dwunastej pozycji. Wtedy też, 13 grudnia 2003 roku w Val di Fiemme po raz pierwszy stanął na podium zawodów pucharowych, zajmując trzecie miejsce w starcie masowym. Aż do zakończenia kariery dokonał tego ponownie tylko raz: 5 grudnia 2004 roku w Trondheim był drugi w sprincie. W międzyczasie wystąpił na mistrzostwach świata w Lahti w 2001 roku, gdzie w swoim jedynym starcie, sprincie, zajął 10. pozycję. Rok później brał udział w igrzyskach olimpijskich w Salt Lake City, gdzie wspólnie z Christophem Bielerem, Mario Stecherem i Felixem Gottwaldem wywalczył brązowy medal w konkursie drużynowym. Po skokach Austriacy zajmowali drugie miejsce i do biegu przystąpili ze stratą 44 sekund do prowadzących Finów. Nie zdołali odrobić tej straty, co więcej w połowie dystansu zostali wyprzedzeni przez Niemców, którzy ostatecznie zdobyli srebro. Na mecie Austriacy stracili 11 sekund do Finów oraz 3,5 sekundy do Niemców. Indywidualnie Michael Gruber zajął 28. miejsce w sprincie.