Biblioteka Watykańska udostępniła też w Internecie kilkaset tysięcy historycznych wolumenów. System komputerowy, stworzony przez firmę Hewlett-Packard, od 2000 jest wykorzystywany do digitalizacji i katalogowania zbiorów – opisów książek, periodyków, druków, ilustracji, rysunków, fotografii, monet, medali, nut, nagrań i płyt CD-ROM – łącznie około 700 tysięcy wpisów bibliograficznych.
Historia Stolica Apostolska gromadziła archiwa i księgi od wczesnych wieków chrześcijaństwa zwane Scrinium Sanctum, zbiory te jednak były rozproszone i brakowało im charakteru stałej, publicznej instytucji. Przemieszczanie się dworu papieskiego oraz okres niewoli awiniońskiej (XIV w.) dodatkowo przyczyniły się do rozproszenia i utraty części zasobów. Za oficjalnego założyciela Biblioteki Watykańskiej uważany jest papież Mikołaj V. W 1448 roku podjął on decyzję o utworzeniu w Pałacu Watykańskim stałej biblioteki, mającej służyć jako instytucja publiczna dostępna dla uczonych (zgodnie z łacińską dewizą pro communi doctorum virorum commodo – dla wspólnego pożytku mężów uczonych). Mikołaj V podczas swojego pontyfikatu powiększał zbiory poprzez zakupy i zlecenia kopii manuskryptów, zwłaszcza greckich.