Napęd Układ napędowy statku składa się z zestawu małych silniczków – przyspieszaczy i z silnika głównego. Przyspieszacze są używane do utrzymywania pozycji sondy oraz do manewrów korygowania orbity. Silnik główny służył do umieszczenia sondy na orbicie Marsa. Silnik główny jest na paliwo dwuskładnikowe: naftę (hydrazynę) i czterotlenek azotu (utleniacz). Ma ciąg 65,3 kg. Cztery przyspieszacze wytwarzają ciąg 100 gramów każdy. Kolejne cztery, używane do obrotu statku, mają ciąg 2,3 kg każdy. Układ napędowy waży 49,7 kg.
Napędem kieruje układ kierowania, nawigacji i kontroli. Określa on i utrzymuje pozycję sondy. Składa się z trzech par czujników (dwie zapasowe). Czujnik Słońca określa położenie Słońca – jest czujnikiem zapasowym względem kamery gwiazdowej. Dane o położeniu wyliczane są na podstawie obserwacji kamery gwiazdowej i uzupełniają informacje zbierane przez inercyjny system kontroli położenia – cztery stabilizatory żyroskopowe (trzy główne, jeden zapasowy). Sonda Odyssey jest stabilizowana w trzech osiach.