Przemysłowa historia Kotowa wiąże się przede wszystkim z przemysłem cegielnianym. Na terenie tej części miasta istniała grupa cegielni, w tym jedne z ostatnich, które działały w granicach Poznania. Szczegóły historii cegielnianej tych rejonów opisano w haśle: Rudnicze (Poznań). Na terenie Kotowa znajduje się zespół glinianek, zwanych potocznie Szachtami, np. Staw Rozlany. Wszystkie cegielnie powstały w czasie wielkiego boomu budowlanego, jaki miał miejsce w Poznaniu na przełomie XIX i XX w., a związany był ze zlikwidowaniem niektórych obwarowań Twierdzy Poznań. Potem produkowały materiały budowlane na potrzeby miasta do lat 90. XX w., kiedy to zlikwidowano ostatnie z zakładów.
W latach 1954–1990 Kotowo należało do dzielnicy Grunwald. W 2000 r. utworzono jednostkę pomocniczą miasta Osiedle Fabianowo-KotowoUchwała Nr XLIX/614/III/2000 Rady Miasta Poznania z dnia 21 grudnia 2000 r. w sprawie utworzenia Osiedla Fabianowo-Kotowo w Poznaniu.