Po połączeniu Akademii Rolniczej z Politechniką Szczecińską, uczelnią funkcjonującą pod tą nazwą od 1955, a wcześniej od 1946 pod nazwą Szkoły Inżynierskiej Wydział stanowi część Zachodniopomorskiego Uniwersytetu Technologicznego w Szczecinie.
Organizacja Wydziału w czasie tych lat zmieniała się od katedralno-zakładowej, poprzez zespoły dydaktyczne oraz instytuty, by powrócić w 1973 do zakładów i katedr. W Szczecinie Wydział kształcił na początku w dwóch specjalnościach: ichtiologia, eksploatacja zasobów i ochrona morza oraz technologia żywności pochodzenia morskiego. Od 1975 prowadzone było kształcenie w specjalności ekonomika i organizacja gospodarki rybnej, która w 1987 została przeniesiona na tworzony wówczas Wydział Ekonomiki i Organizacji Gospodarki Żywnościowej (obecnie Wydział Ekonomiczny Zachodniopomorskiego Uniwersytetu Technologicznego). Od roku akademickiego 1993/1994 wprowadzono dwa oddzielne kierunki kształcenia: rybactwo oraz technologia żywności i żywienie człowieka.
Rybactwo, pierwszy kierunek studiów tego Wydziału obejmował początkowo głównie rybactwo śródlądowe, jednak już od 1953 uległ on rozszerzeniu o rybactwo morskie.