Teren obniża się stopniowo w kierunku zachodnim, przechodząc w płaskowyż (2700–3200 m n.p.m.). Z płaskowyżu wypływają dwie największe rzeki Afryki południowej – Oranje i Tugela.
Najniższy punkt Lesotho znajduje się na wysokości 1380 m n.p.m., co czyni go najwyżej położonym takim punktem na świecie.
Z uwagi na górzysty krajobraz – średnia wysokość n.p.m. to 2161 m – Lesotho nazywane jest niekiedy „Szwajcarią Południowej Afryki”, „dachem Afryki” lub „podniebnym królestwem”. Lesotho jest jedynym krajem na świecie położonym w całości na wysokości powyżej 1000 m n.p.m.
Klimat Lesotho ma klimat zwrotnikowy wilgotny z cechami klimatu wysokogórskiego z powodu wyniesienia.
Zimy są z reguły zimne i suche. Występują wówczas częste przymrozki. W górach, ale też na niższych obszarach, pojawiają się opady śniegu. W najwyższych partiach gór śnieg utrzymuje się przez całą zimę, a temperatura może spadać do –18 °C, a nawet –21 °C.
Lata są gorące i wilgotne – występujące wtedy opady stanowią 85% całkowitych opadów rocznych. Największe opady występują w okresie od października do kwietnia, przy czym od grudnia do lutego większość kraju odnotowuje opady powyżej 100 mm miesięcznie.