2008 Lech Poznań W 0:3 15000 18 27 lutego 2008 Wisła Kraków D 1:1 Zieliński 5000 19 7 marca 2009 Śląsk Wrocław W 0:3 8000 20 14 marca 2009 Ruch Chorzów D 0:3 8000 21 22 marca 2009 Lechia Gdańsk W 1:0 Zieliński 9000 22 4 kwietnia 2009 Polonia Warszawa W 0:1 3000 23 9 kwietnia 2009 Odra Wodzisław D 1:1 Grzyb 5000 24 18 kwietnia 2009 Górnik Zabrze W 0:2 16000 25 24 kwietnia 2009 Cracovia D 1:0 Klepczyński 6000 26 1 maja 2009 GKS Bełchatów W 1:3 Gikiewicz 4000 27 8 maja 2009 Arka Gdynia D 2:1 Klepczyński , Zieliński 6000 28 16 maja 2009 Legia Warszawa W 1:3 Zieliński 4000 29 23 maja 2009 Jagiellonia Białystok D 1:0 Trzeciak 4500 30 30 maja 2009 ŁKS W 0:2 5500

Puchar Ekstraklasy W Pucharze Ekstraklasy Polonia zakończyła rozgrywki na fazie grupowej po zajęciu ostatniego miejsca w grupie B. Lp. Data Przeciwnik Dom /Wyjazd Wynik Bramki Widownia 1 3 września 2008 Odra Wodzisław W 1:2 Wolański 1500 2 7 września 2008 Ruch Chorzów D 1:0 Przybylski 2000 3 8 października 2008 Górnik Zabrze W 0:2 1500 4 11 października 2008 Odra Wodzisław D 0:0 200 5 18 listopada 2008 Ruch Chorzów W 3:4 Sokołenko , Wolański , Bažík 800 6 25 listopada 2008 Górnik Zabrze D 0:2 500 Msc Drużyna Pkt M Z R P Br+ Br− +/−1 Ruch Chorzów9