1 września 1999 r. szkoła zmieniła nazwę na Zespół Szkół „Silesia”. W tym samym roku otwarte zostały dwie klasy Liceum Ogólnokształcącego. Dwa lata później została otwarta Szkoła Policealna o profilu technik informatyk.
Od tej pory kierunki nauczane w szkole były wielokrotnie zmieniane, w zależności od zmieniającej się sytuacji na rynku pracy. Obecnie szkoła kształci w zawodach technik elektryk, technik budownictwa, technik-informatyk, technik informatyk służb mundurowych, fototechnik i technik organizacji reklamy.
1 września 2016 roku szkoła została przeniesiona do budynku Zespołu Szkół Technicznych i Licealnych im. Stanisława Staszica, i działała tam do 31 sierpnia 2021 roku.
Zespół Szkół „Silesia” a sport Od początku swojego istnienia, szkoła współpracowała z Klubem Sportowym Górnik Czechowice. Uczniowie szkoły trenowali kajakarstwo i osiągali w tej dziedzinie bardzo dobre wyniki. Spośród absolwentów szkoły wywodzą się Mistrzowie Świata i Europy: najbardziej znanymi są Grzegorz Kotowicz (maturzysta z 1993 roku, brązowy medalista Igrzysk Olimpijskich w Barcelonie w 1992 r. i IV miejsce w Igrzyskach Olimpijskich w Atlancie w 1996 r., w 1994 r. srebrny medalista w Mistrzostwach Świata), Marek Witkowski (maturzysta z 1995 roku, srebrny medalista w Mistrzostwach Świata w 1994 r.