Trzecia kraina to równina wschodnia z kulminacyjnym szczytem Bugundu o wysokości 1645 m n.p.m.
Klimat Burundi leży w strefie klimatu podrównikowego wilgotnego, jednak jest on zróżnicowany ze względu na ukształtowanie terenu. Warunki pogodowe (opady i temperatura) są więc zróżnicowane. W obszarach najniżej położonych temperatury wahają się od 23 do 25 °C, a roczne zmiany są niewielkie. Im wyżej, tym jest chłodniej, a amplitudy dobowe rosną. Na najwyżej położonych obszarach kraju panuje klimat górski z temperaturami średnio o dziesięć stopni niższymi. Kraj jest bardzo wilgotny, a ilość opadów rośnie wraz z wysokością. Na terenach nisko położonych, zwłaszcza w rejonie jeziora Tanganika, opady wynoszą około 1000 mm. W górach wzrastają do 1800. Roczny rozkład opadów nie ulega większym zmianom ze względu na typ klimatu. W kraju nie ma wyraźnej pory suchej i deszczowej. Przebieg opadów deszczu jest typowy dla obszarów górskich.
Wody Kraj leży zasadniczo w obszarze zlewiska Nilu za pośrednictwem rzeki Kagery i jej dopływów. Część rzek, jak np. Rusizi, należą do dorzecza Konga. Największą rzeką kraju jest Ruvubu. Burundi jest bardzo zasobne w wody. W kraju jest dużo rzek o górskim charakterze.