W 1948 w kuźni zaprzestano bieżącej działalności, a pozostawiony swojemu losowi obiekt zaczął niszczeć. W 1957 kuźnię przejęło Muzeum Techniki w Warszawie; zabezpieczono ocalałe urządzenia i fragmenty budynków, opracowano koncepcję odbudowy, którą przeprowadzono w latach 1960–1963 oraz 1975–1976. Następnie w latach 1976–1978 przeprowadzono konserwację urządzeń i mechanizmów kuźni. 17 czerwca 1978 uroczyście udostępniono kuźnię do zwiedzania. W latach 1978–2016 był oddziałem Muzeum Techniki w Warszawie.
Kuźnia ucierpiała w wyniku powodzi, jaka miała miejsce 14–15 lipca 2016Woda uderzyła w zabytkową kuźnię w Oliwie. „Wyrwało całą ścianę!”, RadioGdansk.pl, 18.07.2016 [dostęp 2016-07-18]..
Kuźnia Wodna w Oliwie jest jedynym tego typu czynnym obiektem w Polsce.
Stan obecny Od 2017 Kuźnia jest w rękach miasta Gdańska. Po przejęciu przez nowego właściciela Kuźnia była zamknięta dla zwiedzających, a obecnie jest udostępniona dla zwiedzających.
Planowane są regulacja biegu przepływającego potoku, a także wymiana dachu, remont ścian oraz instalacji elektrycznej.