Historia Parafia Najświętszej Maryi Panny Królowej w Oławie-Nowym Otoku powstała w listopadzie 2005 r. w wyniku umowy zawartej w październiku 2005 r. po trwających od 2002 r. negocjacjach między prezeską Stowarzyszenia Ducha Świętego Bronisławą Domańską a rzymskokatolicką kurią metropolii wrocławskiej z arcybiskupem Marianem Gołębiewskim na czele, która przekazywała kościół wraz z zabudowaniami wybudowanymi przez działacza katolickiego i pierwszego prezesa założonego w 1999 r. Stowarzyszenia Ducha Świętego Kazimierza Domańskiego Kościołowi katolickiemu.
Do przejęcia kościoła na Nowym Otoku i majątku należącego do Stowarzyszenia Ducha Świętego przez Kościół katolicki doszło 20 października 2005 r., a 9 listopada 2005 r. na walnym zgromadzeniu członkowie Stowarzyszenia Ducha Świętego zadecydowali o likwidacji stowarzyszenia. 6 listopada 2005 r. dziekan oławski Stanisław Bijak odprawił pierwszą oficjalną katolicką mszę świętą w kościele. 16 listopada 2005 r. parafia Najświętszej Maryi Panny Królowej w Nowym Otoku została erygowana, a od 20 listopada 2005 r. w kościele na Nowym Otoku msze święte zaczął sprawować proboszcz ks. Robert Jasik, przeniesiony do parafii z Liceum Katolickiego w Henrykowie, gdzie był zastępcą dyrektora.