W 1994 r. powstała Przychodnia Rehabilitacyjna. W tym samym roku zaczęto organizować pobyty rehabilitacyjne. W 2001 r. przekształcono ośrodek w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością. Powstał Niepubliczny Zakład Opieki Zdrowotnej. Wybudowano część administracyjno-biurową i hotelowo-szkoleniową.
W 2002 r. zakład wzbogacił się o kriokomorę. W 2003 r. ukończono budowę basenu, a w 2006 r. oddano do użytku Oddział Chirurgii Jednego Dnia, Reumoortopedii i Chirurgii Kręgosłupa [dostęp 25 września 2009]..
W 2009 r. zmieniono nazwę ośrodka na Centrum Kompleksowej Rehabilitacji.
Oprócz działalności medycznej CKR prowadzi działalność naukową, nad którą czuwa Rada Naukowo-Konsultacyjna. Istotnym jej elementem jest coroczna organizacja sympozjów naukowych, skierowanych do lekarzy, fizjoterapeutów oraz kadry zarządzającej placówkami medycznymi. Wydarzenia te są okazją do zaprezentowania osiągnięć ośrodka, wymiany wiedzy i doświadczeń, popularyzacji nowości naukowych. Co roku cieszą się dużym zainteresowanie zarówno wśród uczestników, jak i mediów branżowych. Centrum wydaje rocznik pt. „Przegląd Medyczny CKR”, którego adresatami są lekarze i fizjoterapeuci.