Basilius niezwykle rozwinął zbiory sztuki i zabytków rodu Amerbachów. Posiadał rozległą wiedzę na temat kultury starożytnej, był znawcą numizmatyki i epigrafiki rzymskiej. Systematycznie rozwijana przez niego kolekcja sztuki, pamiątek rodzinnych i wszelkiego rodzaju zabytków, Amerbachkabinett, w 1662 przeszła na własność miasta Bazylei, stając się podstawą zbiorów współczesnych muzeów bazylejskich (Muzeum Sztuki w Bazylei).

Był jednym z pionierów archeologii na północ od Alp. Zlecił wykopaliska na terenenie teatru rzymskiego w Augusta Raurica nieopodal Bazylei – stanowiły one pierwsze tego rodzaju przedsięwzięcie badawcze Europy Północnej.

Skrupulanie zbierał wszelkiego rodzaju informacje erudycyjne o starożytności i humanizmie. Jako uczony nie odznaczał się jednak kreatywnością, jego działalność ma charakter antykwaryczny i epigoński.

Jego korespondencja oraz spuścizna prawnicza znajduje się w zbiorach Universitätsbibliothek Basel.

Bibliografia Alfred Hartmann, Amerbach, hasło w: Neue Deutsche Biographie (NDB), Band 1, s. 246;