Pierwsze zwycięstwo było spektakularne. 17 lipca Baur i Hengle zostali zaatakowani przez siedem samolotów francuskich SPAD. Po kilku minutach walki zestrzelili dwa z nich i udało im się bez obrażeń powrócić do bazy. Za ten czyn zostali odznaczeni Bawarskim Srebrnym Medalem za Męstwo.
Okres międzywojenny Po zakończeniu wojny Baur służył w wojsku do 15 kwietnia 1922 roku. Brał między innymi udział w walkach z bolszewikami w 1919 roku w bawarskim , jednym z Freikorpsów, utworzonym przez Franza von Eppa. Następnie służył jako pilot cywilny w kilku liniach lotniczych, między innymi w Bayerischer Luftlloyd. 9 września 1934 roku został osobistym pilotem Adolfa Hitlera.
II wojna światowa Johann Peter Baur przez cały okres II wojny światowej pełnił funkcję osobistego pilota Hitlera i dowódcy dywizjonu rządowego III Rzeszy (der Flugstaffel „Reichsregierung”). 31 stycznia 1944 roku został mianowany generałem (Gruppenführer) SS.