Wedle słów reżysera efektów specjalnych filmu – Sadamasy Arikawy, Zniszczyć wszystkie potwory miał być ostatnim filmem z udziałem Godzilli z powodu słabnącej popularności kaijū i braku pomysłów na kolejne filmy.
Ponieważ akcja toczy się w niedalekiej przyszłości, padają głosy, że film chronologicznie dzieje się po Powrocie Mechagodzilli (1975).
Casting W rolach głównych wystąpili ci sami aktorzy z poprzednich filmów kaijū reżyserowanych przez Hondę, tj. Akira Kubo, Jun Tazaki, Yoshifumi Tajima i Yoshio Tsuchiya. W rolę Kyoko zatrudniona została 21-letnia Yukiko Kobayashi debiutująca we wcześniejszym filmie Hondy, Come Marry Me. Doktora Stevensona zagrał Andrew Hughes, turecki aktor specjalizujący się graniu postaci z Zachodu w japońskich filmach.
Efekty specjalne Budżet filmu wyniósł do rekordowych 200 mln jenów, jednak z powodu dużej liczby potworów i budowli wielkich planów scenograficznych konieczne były oszczędności. Z tego powodu, ku rozczarowaniu Hondy, w gotowym filmie zrezygnowano wielu pomysłów dotyczących działania Wyspy Potworów i skupiono się na niej jedynie się w niewielkim stopniu.