Historia Uczelnia powstała z inicjatywy mgr inż. Marka Krzysztofa Szaraty, od 1998 r. pracującego w branży edukacji niepublicznej. 31 sierpnia 2005 roku Minister Edukacji Narodowej wydał zgodę na powstanie uczelni. Wyższa Szkoła Nauk o Zdrowiu w Bydgoszczy została wpisana do rejestru uczelni niepaństwowych pod numerem 177W nowym rejestrze uczelni wyższych figuruje pod nr 331. i była pierwszą niepaństwową uczelnią medyczną w regionie kujawsko-pomorskim. Pierwszym jej rektorem został prof. dr hab. n. med. Bronisław Zachara.
Początkowo nauczano na kierunkach analityka medyczna i kosmetologia, od 2009 roku także na kierunku fizjoterapiaSzarata Krzysztof Marek: Studiuj nauki medyczne w Bydgoszczy. [w.] Kalendarz Bydgoski 2008.. W listopadzie 2010 r. uczelnia uzyskała prawo do nauczania na kierunku biotechnologiahttps://polon.nauka.gov.pl/opi/aa/run?execution=e2s14 Informacje o szkole w rejestrze uczelni wyższych..