Jerzy Kornowicz obok pracy twórczej prowadzi szeroką działalność społeczną i organizatorską. Był przewodniczącym Koła Młodych Związku Kompozytorów Polskich (1988–1990), członkiem Zarządu Polskiego Towarzystwa Muzyki Współczesnej (1989–1992 i 2002–2007). W latach 2003–2015 sprawował funkcję prezesa Związku Kompozytorów Polskich. Był współinicjatorem utworzenia Rady Organizacji Pozarządowych Ministra Kultury oraz powstania Instytutu Muzyki i Tańca. W latach 2004–2006 był wiceprzewodniczącym Rady Organizacji Pozarządowych Ministra Kultury.

Współorganizował Gdańskie Spotkania Młodych Kompozytorów „Droga” (1989 i 1991), festiwal „Akordy” w Lublinie, koncerty z cyklu „Generacje” w Polskim Radiu, był kuratorem artystycznym festiwalu „Audio Art” w Warszawie i „Przestrzenie dźwięku” w Centrum Sztuki Współczesnej Zamek Ujazdowski w Warszawie. Jest współtwórcą Festiwalu Tradycji i Awangardy Muzycznej „Kody” w Lublinie, którego w latach 2009–2024 był komisarzem artystycznym, oraz pomysłodawcą organizowanego od 2004 „Ogólnopolskiego Skupu Dźwięków Nowych i Używanych”.