Jako doradca J. B. van Heutsza, brał udział w końcowej części wojny w Aceh. Wykorzystywał swoją wiedzę na temat kultury islamu do opracowywania strategii, w sposób znaczący przyczyniając się do stłumienia oporu mieszkańców Aceh i narzucenia im holenderskich rządów kolonialnych. Szacuje się, że w wyniku tych działań wojennych zginęło 50–100 tysięcy ludności miejscowej, a około milion odniosło rany.
W polskiej literaturze o Snoucku Hurgronje pisał Jerzy Koch w rozdziale "Inaczej o Innych - 'Abd al-Ghaffar alias Christiaan Snouck Hurgronje (1857-1936)" w kompendium historii literatury niderlandzkiej "Widzę rzeki szerokie..." Z dziejów literatury niderlandzkiej XIX i XX wieku, t. 2, s. 157-175, pod red. Jerzego Kocha i Piotra Oczki (Poznań 2018).
Wybrana bibliografia Het Mekkaansche feest [Mekkańskie uroczystości świąteczne], Leiden: E.J. Brill, 1880 (praca doktorska). Mekkanische Sprichwörter und Redensarten [Mekkańskie przysłowia i wyrażenia], 1886 De beteekenis van den Islam voor zijne belijders in Oost-Indie [Znaczenie islamu dla jego wyznawców w Indiach Wschodnich], 1883 Mr. L. W. C. van den Berg’s beoefening van het mohammedanisch recht [Praktyka prawa muzułmańskiego według Van der Berga], 1884 Der Mahdi, 1885 Mohamm.