Powołuje ją i rozwiązuje Naczelnik Harcerzy ZHR.
Celem chorągwi harcerzy jest: kształcenie i dbanie o rozwój instruktorów, kontrola pracy hufców i związków drużyn na terenie chorągwi, nadzór nad obozami letnimi i zimowymi, aktywne uczestnictwo w pracach Organizacji Harcerzy,
Chorągiew harcerzy tworzy: sekretariat, referat zuchowy, referat harcerski, referat wędrowniczy, szkoła instruktorska.
W Organizacji Harcerzy ZHR funkcjonuje 14 chorągwi: Dolnośląska Chorągiew Harcerzy ZHR Górnośląska Chorągiew Harcerzy ZHR Kujawsko-Pomorska Chorągiew Harcerzy ZHR Lubelska Chorągiew Harcerzy ZHR Łódzka Chorągiew Harcerzy ZHR Małopolska Chorągiew Harcerzy ZHR Mazowiecka Chorągiew Harcerzy ZHR Chorągiew Harcerzy Ziemi Opolskiej ZHR Pomorska Chorągiew Harcerzy ZHR Podkarpacka Chorągiew Harcerzy ZHR Północno-Wschodnia Chorągiew Harcerzy ZHR Północno-Zachodnia Chorągiew Harcerzy ZHR Staropolska Chorągiew Harcerzy ZHR Wielkopolska Chorągiew Harcerzy ZHR