MSV Duisburg W lecie 1987 roku Lienen opuścił Mönchengladbach i dołączył do MSV Duisburg, gdzie po zakończeniu kariery został szkoleniowcem pierwszego zespołu. W 1989 zdobył licencję szkoleniowca z najwyższą notą. Wówczas nadal był jeszcze piłkarzem Duisburga, występującego w 3. lidze, a klub wywalczył awans do 2. Bundesligi. Dwa lata później wywalczył sobie grę na najwyższym szczeblu z Lienenem w składzie. Po roku spędzonym w 1. Bundeslidze klub został zdegradowany, a piłkarz zadecydował o zakończeniu swojej barwnej kariery po wygranym 3:0 meczu przez Duisburg z 1. FC Nürnberg w ostatniej kolejce zmagań.
Kariera trenerska Lienen pozostał w MSV, gdzie najpierw prowadził rezerwy. Szybko otrzymał szansę prowadzenia seniorów. W lecie 1993 klub powrócił do 1. Bundesligi. Z Lienenem na ławce trenerskiej uplasował się na wysokim 9. miejscu. Rok później sytuacja nie wyglądała równie imponująco i zespół zajmował w listopadzie ostatnie miejsce w lidze z dwoma punktami na koncie na 22 możliwe. Lienen został zwolniony po katastrofalnej porażce 0:5 z Hamburgerem SV na własnym boisku.