27 stycznia 1927 roku została erygowana parafia w Wojkowicach Komornych. 8 października 1929 roku rozpoczęto kopanie fundamentów kościoła, według projektu architektów Stefana Szyllera i Wiesława Kononowicza. 7 października 1930 roku Urząd Wojewódzki w Kielcach oficjalnie zatwierdził projekt architektoniczny i wydał pozwolenie na budowę świątyni i plebanii. 8 czerwca 1931 roku rozpoczęto wznoszenie ścian kościoła. W 1936 roku odprawiono pierwsze nabożeństwo w kościele będącym w trakcie budowy, a 5 września 1937 roku poświęcono kamień węgielny. Patronem kościoła został św. Antoni Padewski, a parafii św. Jan Nepomucen.
W czasie II wojny światowej, prace budowlane wstrzymano. W 1948 roku rozpoczęto budowę plebanii. 29 i 30 września 1956 roku bp częstochowski Zdzisław Goliński dokonał konsekracji kościoła. W 1959 roku kościółek św. Jana Nepomucena został rozebrany. 31 grudnia 1961 roku osiedle Wojkowice Komorne i gromada Żychcice zostały połączone jako osiedle Wojkowice, które w 1962 roku otrzymało prawa miejskie. W 1967 roku parafia zmieniła nazwę na pw. św. Antoniego Padewskiego. 25 marca 1992 roku parafia weszła w skład nowej diecezji sosnowieckiej.