1 stycznia 2009 w zoo znajdowało się 4203 zwierząt – przedstawicieli 533 gatunków, w tym: ssaki – 78 gatunków, 378 szt. ptaki – 224 gatunki, 1058 szt. gady – 53 gatunki, 53 szt. płazy – 14 gatunków, 173 szt. ryby – 79 gatunków, 948 szt. bezkręgowce – 85 gatunków pozostałe – zwierzęta laboratoryjneWarszawskie Zoo – Zaprasza..
31 grudnia 2011 w zoo znajdowało się 3566 zwierząt – przedstawicieli 553 gatunków, w tym: ssaki – 67 gatunków, 717 szt. ptaki – 198 gatunków, 951 szt. gady – 86 gatunków, 316 szt. płazy -30 gatunków, 354 szt. ryby – 83 gatunki, 1062 szt. bezkręgowce – 89 gatunków, 166 szt. policzalnych zwierzęta laboratoryjne – 2 gatunki, 310 szt
Wszystkie zwierzęta, które urodziły się w ogrodzie w danym roku, otrzymują imiona zaczynającą się na tę samą literę (np. w 2018 na „J”).
Ważniejsze obiekty i ich fauna Słoniarnia Jedna z najnowocześniejszych w Europie, 6000 m². Na rok 2012 zoo zamieszkiwały cztery słonie afrykańskie (Loxodonta africana) – jeden samiec i trzy samice. W wewnętrznej części słoniarni znajduje się również wydzielona część dla góralków przylądkowych (Procavia capensis).