W późniejszym okresie artysta zainteresował się centrum Paryża i malował głównie przedstawicieli klasy średniej. Zajmował się też tworzeniem ilustracji, litografią i rzeźbą, publikował na tematy artystyczne. W 1885 otrzymał w Salonie medal honoru, a w 1889 złoty medal na paryskiej wystawie światowej. Dwukrotnie, w 1889 i 1906 wyróżniano go Legią Honorową, był członkiem Towarzystwa Sztuk Pięknych. Popularność zdobył też w Stanach Zjednoczonych, gdzie przebywał dwukrotnie w latach 1895 i 1897.
Zmarł w 1924, spoczywa na Cmentarzu Père-Lachaise.
Ilustracje Joris-Karl Huysmans: Croquis parisiens, eaux-fortes de Forain et Raffaëlli, Paris : H. Vaton, 1880 dostępny online Octave Mirbeau: Contes de la chaumière, Paryż: G. Charpentier i E. Fasquelle, 1894 Claudius Madrolle: En Guinée, ilustracje J.-F. Raffaëlli, Paryż: H. Le Soudier, 1895 Gustave Coquiot: Le Vrai J.-K. Huysmans, préface de J. K. Huysmans, avec un portrait par J.-F. Raffaëlli, Paryż: C. Bosse, 1912