W sezonie 2008/09 zwyciężył w grupie I i zdobył promocję do czwartoligowej Lega Pro Seconda Divisione.
16 lipca 2012 klub ogłosił, że nie przystępuje do następnego turnieju Lega Pro Prima Divisione i wraca do rozgrywek regionalnych. Stowarzyszenie kontynuuje pracę z młodzieżą i zmieniło nazwę na A.S.D. Città di Siracusa. W 2013 zwyciężył w Terza Categoria Siracusa i awansował do Seconda Categoria Siracusa. 25 czerwca 2013 wraz z przeniesieniem tytułu sportowego Eccellenza klub Associazione Calcio Palazzolo założył A.S.D. Sport Club Siracusa, który na mocy wyrzeczenia połączył A.S.D. Città di Siracusa. W sezonie 2013/14 zajął najpierw trzecie miejsce w grupie B Eccellenza Sicilia, ale przegrał w finale play-off. Latem 2014 klub przywrócił nazwę A.S.D. Città di Siracusa. W następnym sezonie po zajęciu pierwszego miejsca w grupie B Eccellenza Sicilia awansował do Serie D, a w sezonie 2015/16 po zajęciu pierwszego miejsca w grupie I awansował do Lega Pro.