Testy te mają ograniczoną czułość i swoistość.
Leczenie Najważniejsze w leczeniu jest usunięcie w miarę możliwości przyczyny wywołującej zespół rozrostu bakteryjnego.
Antybiotykoterapia Leczenie prowadzi się przez 2–4 tygodnie stosując antybiotyki działające na tlenowe i beztlenowe bakterie Gram-ujemne, w przypadku nawrotu powtórna terapia trwa 4–8 tygodni. Jako leki pierwszego rzutu podaje się zwykle metronidazol w połączeniu z doksycykliną. Do najczęściej stosowanych leków należą: metronidazol, doksycyklina, tetracyklina, amoksycylina w połączeniu z kwasem klawulanowym, cyprofloksacyna, norfloksacyna, kotrimoksazol, wankomycyna. Pojawiły się doniesienia o skutecznym i bezpiecznym zastosowaniu w rozroście bakteryjnym ryfaksyminy.
Uzupełnienie niedoborów W zależności od stwierdzanych objawów uzupełnia się niedobory witamin A, D, E i B12. Witaminy K nie uzupełnia się mimo zaburzeń jej wchłaniania ze względu na produkcję tej witaminy przez kolonizującą jelito florę bakteryjną.
Inne leki Stosuje się probiotyki oraz cholestyraminę, która poprzez wiązanie kwasów żółciowych