Serwis Anime News Network podał, że na początku 2010 roku, w Japonii sprzedane ponad 1 milion egzemplarzy każdego tomu mangi, co uplasowało ją wówczas na 7. miejscu, spośród najlepiej sprzedających się mang. Recenzenci polskojęzycznego serwisu tanuki.pl przyznali mandze najwyższą możliwą ocenę 10/10, natomiast ocena redakcji wyniosła 9/10.
Anime W 2003 roku Fullmetal Alchemist zdobyło nagrodę dla najlepszego anime, w cyklu Anime Grand Prix, organizowanym przez magazyn Animage. Odcinki 7. (pt. „Wieczorny płacz chimery”) oraz 51. (pt. „Monachium 1921”) zostały uznane za najlepsze w latach 2003 i 2004. Nagrodę zdobyła także piosenka Melissa nagrana przez grupę Porno Graffitti. W 2004 roku anime zdobyło podobną nagrodę – Tokyo Anime Award, w kategorii telewizyjnej. Został tam także nagrodzony najlepszy scenariusz (Shō Aikawa w 2004) i najlepsza muzyka (Michiru Ōshima w 2006). Anime spotkało się z w miarę przychylnymi opiniami polskojęzycznego serwisu tanuki.pl – zarówno recenzenci jak i redakcja wystawili średnią ocenę 7/10.